TomatoPangenome - an open-source platform for studying tomato super-pangenome in the genus Solanum

Download panel

Genomic data

Group	Species	Genome sequences	Original CDSs	Original Peptides	Filtered CDSs	Filtered Peptides
Wild Species	S. lycopersicoides LA2951	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. chilense LA1969	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. chmielewskii LA1028	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. corneliomulleri LA1331	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. galapagense LA0436	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. galapagense LA0317	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. habrochaites LA1777	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. habrochaites LA0407	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. neorickii LA0247	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. neorickii LA2133	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pennellii LA0716	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pennellii LA716a	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. peruvianum LA0446	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
Ancestral Species	S. pimpinellifolium BGV006775	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA0400	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA1242	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA1269	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA1547	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA2093	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA2181	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA2187	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium LA2656	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium PAS014479	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. pimpinellifolium Wva 700	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
Early Domesticates	S. lycopersicum BGV006865	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum BGV007931	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum BGV007989	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Cerise du sud ouest N 2	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Cerise Gold	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA0292	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA1228	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA1286	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA1456	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA1464	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Peacevine Cherry	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Sugar Lump	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
Early Cultivars(vintage)	S. lycopersicum Brandywine	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA0118	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum PI169588	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum PI303721	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
Modern Domesticates	S. lycopersicum EA01020	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum EA03083	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum EA04939	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA0404	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA1706	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA2009	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA2706	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA2838A	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA3475 M82	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA3840	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA3911 MicroTom	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA4345 Heinz1706	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA4347	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Scatolone di bolsena	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum TS331	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Yellow_Pear	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum yoku improvement	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
Modern Cultivars (fresh market)	S. lycopersicum EA00371	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum Fla.8924	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LA3242	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep
	S. lycopersicum LYC1410	genome	cds.orign	pep.orign	cds	pep

Orthologous Group